Рыбоподъемники и рыбоходы различных конструкций имеют свою специфику, однако характер выполнения отдельных операций, особенно по привлечению рыб, мало чем отличается. Условия эксплуатации рыбопропускных сооружений достаточно подробно изложены в инструкциях по их эксплуатации.

При работе рыбопропускных сооружений следят за тем. чтобы скорости потока в зоне вывода уставшей рыбы были незначительны и легко преодолевались ею. Эти скорости зависят от режима работы примыкающих водопропускных отверстий плотины или других сооружений. При этом нельзя допускать сноса рыб потоком в нижний бьеф.

Промывку бьефов водозаборного узла от наносов, когда требуется открывать все пролеты плотины, желательно совмещать с периодом максимального прохода рыб на нерест. В этом случае возможен массовый проход рыбы в верхний бьеф.

Снос молоди из зоны нереста вниз по течению происходит большей частью самопроизвольно. Этот вопрос изучен крайне мало. На низконапорных гидроузлах рыбы способны проходить через открытые отверстия плотин и других сооружений. Поэтому в целях предупреждения травмирования рыб их лучше пропускать через сооружения, не имеющие в нижнем бьефе гасителей энергии в виде шашек, пирсов, растекателей и т. д.

Схему маневрирования затворами плотины, особенно в период прохода рыб на нерест, увязывают с работой рыбопропускных сооружений из условия создания на более длинном участке потока с привлекающими скоростями и максимального привлечения рыб к рыбопропускному сооружению.