Для того чтобы обеспечить нормальный наносный режим в магистральном канале, используют отстойники для аккумуляции в них наносов или участки каналов, заменяющие их и подлежащие периодической очистке гидромеханическими средствами. При этом соблюдают первоначальную форму канала с точностью ±0,1...0,2 м. При наличии сбросных сооружений с низким порогом возможна периодическая очистка канала путем смыва наносов при повышенных скоростях в результате снижения уровней воды в нем и пропуска повышенных расходов. Гидравлическую очистку (промывку) от наносов лучше проводить в облицованных каналах, а механическую (с помощью землесосов) - на каналах в земляном русле. В отдельных случаях, если капал можно периодически осушать, для очистки его от наносов используют землеройные машины: бульдозеры, грейдеры, экскаваторы. В Средней Азии для осаждения наносов достаточно широко применяют озеровидные отстойники. Для этой цели выбирают естественные понижения, которые после их заиления отключают от водотока, осушают и применяют для сельскохозяйственного использования, а заилению подвергаются другие пониженные участки местности.

Важным средством борьбы с наносами является также своевременная очистка нагорных канав, ловчих каналов, поддержание в рабочем состоянии селезащитных и сооружений, насаждение лесозащитных полос вдоль каналов и др.